Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LBX1P52954 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LBX1P52954 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LBX1P52954 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LBX1P52954 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LBX1P52954 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LBX1P52954 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LBX1P52954 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LBX1P52954 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LBX1P52954 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LBX1P52954 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LBX1P52954 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LBX1P52954 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LBX1P52954 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LBX1P52954 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LBX1P52954 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LBX1P52954 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LBX1P52954 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LBX1P52954 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LBX1P52954 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LBX1P52954 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBX1P52954 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBX1P52954 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBX1P52954 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBX1P52954 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBX1P52954 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBX1P52954 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBX1P52954 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LBX1P52954 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LBX1P52954 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBX1P52954 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBX1P52954 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBX1P52954 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LBX1P52954 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBX1P52954 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBX1P52954 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBX1P52954 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBX1P52954 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBX1P52954 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBX1P52954 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBX1P52954 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LBX1P52954 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBX1P52954 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBX1P52954 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LBX1P52954 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBX1P52954 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LBX1P52954 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBX1P52954 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LBX1P52954 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LBX1P52954 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LBX1P52954 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LBX1P52954 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LBX1P52954 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LBX1P52954 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LBX1P52954 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LBX1P52954 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LBX1P52954 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LBX1P52954 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LBX1P52954 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LBX1P52954 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LBX1P52954 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LBX1P52954 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LBX1P52954 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LBX1P52954 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LBX1P52954 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LBX1P52954 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LBX1P52954 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LBX1P52954 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LBX1P52954 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LBX1P52954 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LBX1P52954 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LBX1P52954 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LBX1P52954 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LBX1P52954 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LBX1P52954 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LBX1P52954 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms