Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFC4P35249 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC4P35249 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC4P35249 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC4P35249 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC4P35249 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC4P35249 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC4P35249 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC4P35249 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC4P35249 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC4P35249 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC4P35249 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC4P35249 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC4P35249 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC4P35249 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC4P35249 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC4P35249 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC4P35249 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC4P35249 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFC4P35249 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFC4P35249 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC4P35249 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC4P35249 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC4P35249 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC4P35249 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC4P35249 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC4P35249 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC4P35249 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC4P35249 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC4P35249 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC4P35249 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC4P35249 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC4P35249 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFC4P35249 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC4P35249 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC4P35249 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC4P35249 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC4P35249 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC4P35249 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC4P35249 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC4P35249 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC4P35249 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC4P35249 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC4P35249 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC4P35249 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC4P35249 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC4P35249 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC4P35249 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC4P35249 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC4P35249 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC4P35249 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFC4P35249 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC4P35249 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC4P35249 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC4P35249 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC4P35249 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC4P35249 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC4P35249 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC4P35249 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC4P35249 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC4P35249 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC4P35249 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC4P35249 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC4P35249 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC4P35249 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFC4P35249 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC4P35249 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC4P35249 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC4P35249 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC4P35249 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC4P35249 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC4P35249 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC4P35249 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC4P35249 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC4P35249 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFC4P35249 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms