Protein–RNA interactions for Protein: P32115

Pax4, Paired box protein Pax-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax4P32115 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax4P32115 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pax4P32115 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms