Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cd28P31041 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cd28P31041 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms