Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COL4A5P29400 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COL4A5P29400 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms