Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Htr3aP23979 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Htr3aP23979 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms