Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATP4AP20648 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATP4AP20648 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms