Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PCNX2A6NKB5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PCNX2A6NKB5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms