Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP17L4A6NCW7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP17L4A6NCW7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms