Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms