Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
EHD3Q9NZN3 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms