Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms