Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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SYNE4Q8N205 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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SYNE4Q8N205 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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SYNE4Q8N205 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SYNE4Q8N205 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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