Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
RTL8BQ17RB0 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
RTL8BQ17RB0 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms