Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 FOXD1-AS1-201ENST00000514661 424 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
RUNX3Q13761 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RUNX3Q13761 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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