Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC243756.2-201ENST00000618406 463 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1BQ13112 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms