Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SH3BP1Q9Y3L3 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms