Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SHOC2Q9UQ13 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms