Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CCSER1Q9C0I3 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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