Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TM6SF1Q9BZW5 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TM6SF1Q9BZW5 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms