Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TRAPPC9Q96Q05 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms