Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
PDK4Q16654 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms