Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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SYCP1Q15431 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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SYCP1Q15431 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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SYCP1Q15431 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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SYCP1Q15431 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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SYCP1Q15431 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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SYCP1Q15431 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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SYCP1Q15431 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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SYCP1Q15431 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SYCP1Q15431 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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