Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NME3Q13232 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NME3Q13232 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NME3Q13232 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NME3Q13232 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NME3Q13232 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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