Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
CHAF1BQ13112 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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