Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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IFT88Q13099 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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IFT88Q13099 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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IFT88Q13099 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
IFT88Q13099 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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IFT88Q13099 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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IFT88Q13099 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
IFT88Q13099 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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