Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
PTPRGP23470 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
PTPRGP23470 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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