Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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RFXAPO00287 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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RFXAPO00287 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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RFXAPO00287 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
RFXAPO00287 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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