Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 PLSCR5-202ENST00000482567 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms