Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
COL24A1Q17RW2 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms