Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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CCDC142Q17RM4 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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CCDC142Q17RM4 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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CCDC142Q17RM4 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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CCDC142Q17RM4 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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CCDC142Q17RM4 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
CCDC142Q17RM4 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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