Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
IMPG1Q17R60 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 NDUFA5P1-201ENST00000433858 341 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
IMPG1Q17R60 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms