Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AF130359.1-201ENST00000444868 438 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 OR5AN2P-201ENST00000534535 896 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
BRD3Q15059 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.6 ms