Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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TOP3AQ13472 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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TOP3AQ13472 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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TOP3AQ13472 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
TOP3AQ13472 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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