Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 IFI44-201ENST00000370747 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 KYNUP1-201ENST00000466683 1406 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC007679.2-201ENST00000422116 781 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AP000431.1-201ENST00000424219 469 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 VNN3-208ENST00000427187 1214 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 RPL3P8-201ENST00000432928 1191 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 RPL10P6-201ENST00000457497 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AL035660.2-201ENST00000461248 556 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 RN7SL505P-201ENST00000482644 293 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 NDUFB2-215ENST00000482954 544 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 ZNF695-204ENST00000487338 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC025188.1-201ENST00000507514 600 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 EEF1B2P2-201ENST00000519625 676 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 IGHVIII-26-1-201ENST00000520387 250 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC123767.1-204ENST00000523523 273 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC087280.1-201ENST00000530632 1003 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC012157.1-201ENST00000549725 501 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC016526.1-201ENST00000555465 520 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 SPATA8-AS1-202ENST00000560888 392 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC023813.3-201ENST00000561876 539 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC243312.1-201ENST00000570582 275 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC093063.1-201ENST00000599317 363 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC129492.5-201ENST00000603489 315 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC103974.2-201ENST00000611319 778 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC239600.2-201ENST00000619615 1165 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC013562.1-201ENST00000519427 1722 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 TRIM60P14-201ENST00000513444 1419 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 FBLN5-205ENST00000556154 1875 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
VAMP1P23763 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms