Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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PTPRAP18433 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
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PTPRAP18433 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
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PTPRAP18433 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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PTPRAP18433 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
PTPRAP18433 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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