Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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LRRTM2O43300 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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LRRTM2O43300 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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LRRTM2O43300 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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LRRTM2O43300 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
LRRTM2O43300 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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