Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC073365.1-203ENST00000641055 1992 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFXAPO00287 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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