Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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ARL2-SNX15V9GYD0 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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ARL2-SNX15V9GYD0 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ARL2-SNX15V9GYD0 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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