Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
USP35Q9P2H5 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
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