Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
SALL3Q9BXA9 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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SALL3Q9BXA9 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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SALL3Q9BXA9 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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SALL3Q9BXA9 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SALL3Q9BXA9 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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