Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
LRIG3Q6UXM1 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms