Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 CU633967.1-204ENST00000624627 1604 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 PSG9-206ENST00000593948 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 FKTN-202ENST00000357998 2404 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
ANKRD39Q53RE8 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ODF1-201ENST00000285402 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 OR2T10-201ENST00000330500 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 PPIAP25-201ENST00000420177 540 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 HMGA1P4-201ENST00000428643 334 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 FO393419.1-201ENST00000443746 355 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 POLR2CP1-201ENST00000453699 765 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 RPL29P11-201ENST00000494408 492 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC008525.1-201ENST00000508719 676 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC097518.1-201ENST00000512516 421 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 DCAF13P2-201ENST00000514188 555 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MTND6P19-201ENST00000519399 524 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MTND6P3-201ENST00000520612 542 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC010834.2-201ENST00000523945 530 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC110058.1-201ENST00000530389 563 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AP000442.2-201ENST00000531108 440 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LINC02454-202ENST00000541391 612 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LRRC37A13P-201ENST00000546055 287 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC025165.2-201ENST00000549477 699 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC015871.1-201ENST00000557880 1081 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC012186.1-201ENST00000566702 398 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL358394.3-202ENST00000599308 832 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC090950.1-201ENST00000604625 830 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MIR6848-201ENST00000611213 70 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AL022345.3-201ENST00000611406 228 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC244472.3-201ENST00000611520 428 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 TTR-205ENST00000613781 556 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.175-201ENST00000619837 250 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 SMIM11B-204ENST00000623661 1021 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC008870.5-201ENST00000624143 650 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MIR7515HG-257ENST00000625915 852 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 PPP3R2-202ENST00000636434 1081 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 MTA3-201ENST00000405094 1785 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ANKRD39Q53RE8 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms