Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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SYCP1Q15431 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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SYCP1Q15431 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SYCP1Q15431 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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