Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PDCD1Q15116 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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PDCD1Q15116 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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PDCD1Q15116 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PDCD1Q15116 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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