Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CACNA1SQ13698 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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