Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
GPS1Q13098 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
GPS1Q13098 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms