Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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TRAF1Q13077 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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