Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL669831.5-218ENST00000591702 1873 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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PTPRMP28827 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTPRMP28827 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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