Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
ERVV-2B6SEH9 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
ERVV-2B6SEH9 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms